Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRAGBQ5VZM2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRAGBQ5VZM2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms