Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOCADQ5VW36 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms