Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHAF4Q5VUM1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAF4Q5VUM1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms