Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM69BQ5VUD6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM69BQ5VUD6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms