Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN9Q5TKA1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN9Q5TKA1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIN9Q5TKA1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN9Q5TKA1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN9Q5TKA1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN9Q5TKA1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN9Q5TKA1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN9Q5TKA1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN9Q5TKA1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN9Q5TKA1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN9Q5TKA1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN9Q5TKA1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN9Q5TKA1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN9Q5TKA1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN9Q5TKA1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIN9Q5TKA1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN9Q5TKA1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN9Q5TKA1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN9Q5TKA1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN9Q5TKA1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN9Q5TKA1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN9Q5TKA1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN9Q5TKA1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN9Q5TKA1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms