Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BEND3Q5T5X7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BEND3Q5T5X7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms