Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HIVEP3Q5T1R4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms