Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CC2D1BQ5T0F9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms