Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NHSL1Q5SYE7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NHSL1Q5SYE7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms