Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC38Q5R3I4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC38Q5R3I4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms