Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNT1Q5JUK3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms