Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PITRM1Q5JRX3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms