Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL5Q5HYW3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL5Q5HYW3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms