Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC178Q5BJE1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms