Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TDRD12Q587J7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD12Q587J7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms