Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms