Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VWA3BQ502W6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VWA3BQ502W6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3BQ502W6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms