Protein–RNA interactions for Protein: Q4W5G0

TIGD2, Tigger transposable element-derived protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD2Q4W5G0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIGD2Q4W5G0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIGD2Q4W5G0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms