Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC0

ATP13A5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A5Q4VNC0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A5Q4VNC0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A5Q4VNC0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms