Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms