Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS10Q3MIT2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS10Q3MIT2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS10Q3MIT2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS10Q3MIT2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS10Q3MIT2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS10Q3MIT2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS10Q3MIT2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS10Q3MIT2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS10Q3MIT2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS10Q3MIT2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS10Q3MIT2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS10Q3MIT2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS10Q3MIT2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS10Q3MIT2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS10Q3MIT2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS10Q3MIT2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS10Q3MIT2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PUS10Q3MIT2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUS10Q3MIT2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms