Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TWISTNBQ3B726 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TWISTNBQ3B726 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms