Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HFEQ30201 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HFEQ30201 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HFEQ30201 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HFEQ30201 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HFEQ30201 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HFEQ30201 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HFEQ30201 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HFEQ30201 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HFEQ30201 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HFEQ30201 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HFEQ30201 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HFEQ30201 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HFEQ30201 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HFEQ30201 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HFEQ30201 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HFEQ30201 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HFEQ30201 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HFEQ30201 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HFEQ30201 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HFEQ30201 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HFEQ30201 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HFEQ30201 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HFEQ30201 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HFEQ30201 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HFEQ30201 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HFEQ30201 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HFEQ30201 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HFEQ30201 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HFEQ30201 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HFEQ30201 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HFEQ30201 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HFEQ30201 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HFEQ30201 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HFEQ30201 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HFEQ30201 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HFEQ30201 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HFEQ30201 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HFEQ30201 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HFEQ30201 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HFEQ30201 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HFEQ30201 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HFEQ30201 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HFEQ30201 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HFEQ30201 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HFEQ30201 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HFEQ30201 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HFEQ30201 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms