Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHT3

CLEC16A, Protein CLEC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC16AQ2KHT3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC16AQ2KHT3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC16AQ2KHT3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms