Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
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TXNRD1Q16881 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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TXNRD1Q16881 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXNRD1Q16881 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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