Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSRP2Q16527 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSRP2Q16527 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms