Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMGN3Q15651 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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