Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RYR3Q15413 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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RYR3Q15413 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RYR3Q15413 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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RYR3Q15413 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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