Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE3CQ15386 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3CQ15386 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
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