Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PCOLCEQ15113 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PCOLCEQ15113 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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