Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB3GAP1Q15042 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3GAP1Q15042 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB3GAP1Q15042 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
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