Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HDM1Q15032 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.57■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.57■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.56■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.55■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.55■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.54■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.53■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
R3HDM1Q15032 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
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