Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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ODF1Q14990 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ODF1Q14990 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ODF1Q14990 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF1Q14990 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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