Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBM39Q14498 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBM39Q14498 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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