Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H2Q13888 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2H2Q13888 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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