Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
SHROOM2Q13796 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SHROOM2Q13796 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SHROOM2Q13796 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
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