Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF4BQ13523 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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