Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBB3Q13509 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TUBB3Q13509 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBB3Q13509 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TUBB3Q13509 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB3Q13509 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB3Q13509 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB3Q13509 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB3Q13509 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB3Q13509 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUBB3Q13509 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB3Q13509 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB3Q13509 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUBB3Q13509 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB3Q13509 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB3Q13509 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB3Q13509 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB3Q13509 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB3Q13509 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB3Q13509 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB3Q13509 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB3Q13509 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB3Q13509 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB3Q13509 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TUBB3Q13509 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB3Q13509 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB3Q13509 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB3Q13509 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB3Q13509 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB3Q13509 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB3Q13509 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TUBB3Q13509 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TUBB3Q13509 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TUBB3Q13509 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB3Q13509 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB3Q13509 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB3Q13509 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB3Q13509 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB3Q13509 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB3Q13509 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TUBB3Q13509 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB3Q13509 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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