Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLFQ13129 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RLFQ13129 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RLFQ13129 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLFQ13129 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLFQ13129 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLFQ13129 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RLFQ13129 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLFQ13129 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLFQ13129 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLFQ13129 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLFQ13129 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLFQ13129 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLFQ13129 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLFQ13129 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLFQ13129 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLFQ13129 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RLFQ13129 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLFQ13129 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLFQ13129 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLFQ13129 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLFQ13129 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLFQ13129 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLFQ13129 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLFQ13129 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RLFQ13129 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLFQ13129 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RLFQ13129 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLFQ13129 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLFQ13129 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLFQ13129 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLFQ13129 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLFQ13129 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLFQ13129 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLFQ13129 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLFQ13129 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLFQ13129 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RLFQ13129 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLFQ13129 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLFQ13129 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLFQ13129 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLFQ13129 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLFQ13129 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLFQ13129 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RLFQ13129 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLFQ13129 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLFQ13129 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLFQ13129 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLFQ13129 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RLFQ13129 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLFQ13129 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLFQ13129 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RLFQ13129 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RLFQ13129 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RLFQ13129 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RLFQ13129 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLFQ13129 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLFQ13129 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLFQ13129 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLFQ13129 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLFQ13129 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RLFQ13129 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RLFQ13129 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RLFQ13129 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLFQ13129 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLFQ13129 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLFQ13129 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLFQ13129 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLFQ13129 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLFQ13129 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLFQ13129 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLFQ13129 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RLFQ13129 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RLFQ13129 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RLFQ13129 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLFQ13129 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLFQ13129 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLFQ13129 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLFQ13129 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLFQ13129 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLFQ13129 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLFQ13129 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLFQ13129 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RLFQ13129 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLFQ13129 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLFQ13129 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLFQ13129 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLFQ13129 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLFQ13129 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RLFQ13129 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLFQ13129 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLFQ13129 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RLFQ13129 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLFQ13129 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLFQ13129 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RLFQ13129 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLFQ13129 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLFQ13129 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLFQ13129 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RLFQ13129 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms