Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RESTQ13127 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RESTQ13127 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RESTQ13127 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RESTQ13127 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RESTQ13127 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RESTQ13127 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RESTQ13127 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RESTQ13127 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RESTQ13127 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RESTQ13127 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RESTQ13127 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RESTQ13127 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RESTQ13127 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RESTQ13127 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RESTQ13127 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RESTQ13127 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RESTQ13127 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RESTQ13127 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RESTQ13127 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RESTQ13127 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RESTQ13127 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RESTQ13127 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RESTQ13127 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RESTQ13127 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RESTQ13127 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RESTQ13127 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RESTQ13127 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RESTQ13127 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RESTQ13127 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RESTQ13127 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RESTQ13127 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RESTQ13127 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RESTQ13127 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RESTQ13127 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RESTQ13127 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RESTQ13127 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RESTQ13127 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RESTQ13127 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RESTQ13127 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RESTQ13127 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RESTQ13127 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RESTQ13127 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RESTQ13127 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RESTQ13127 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RESTQ13127 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RESTQ13127 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RESTQ13127 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RESTQ13127 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RESTQ13127 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RESTQ13127 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RESTQ13127 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RESTQ13127 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RESTQ13127 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RESTQ13127 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RESTQ13127 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RESTQ13127 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RESTQ13127 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RESTQ13127 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RESTQ13127 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RESTQ13127 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RESTQ13127 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RESTQ13127 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RESTQ13127 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RESTQ13127 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RESTQ13127 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RESTQ13127 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RESTQ13127 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RESTQ13127 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RESTQ13127 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RESTQ13127 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RESTQ13127 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RESTQ13127 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RESTQ13127 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RESTQ13127 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RESTQ13127 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RESTQ13127 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RESTQ13127 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RESTQ13127 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RESTQ13127 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RESTQ13127 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RESTQ13127 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RESTQ13127 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RESTQ13127 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RESTQ13127 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RESTQ13127 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RESTQ13127 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RESTQ13127 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RESTQ13127 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RESTQ13127 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RESTQ13127 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RESTQ13127 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RESTQ13127 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RESTQ13127 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RESTQ13127 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RESTQ13127 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RESTQ13127 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RESTQ13127 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RESTQ13127 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RESTQ13127 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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