Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CDC16Q13042 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC16Q13042 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC16Q13042 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC16Q13042 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC16Q13042 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC16Q13042 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC16Q13042 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC16Q13042 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC16Q13042 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC16Q13042 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC16Q13042 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC16Q13042 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC16Q13042 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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