Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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