Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPN13Q12923 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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