Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COX10Q12887 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COX10Q12887 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COX10Q12887 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COX10Q12887 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COX10Q12887 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COX10Q12887 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COX10Q12887 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COX10Q12887 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COX10Q12887 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COX10Q12887 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COX10Q12887 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COX10Q12887 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COX10Q12887 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COX10Q12887 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COX10Q12887 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COX10Q12887 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COX10Q12887 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COX10Q12887 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COX10Q12887 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COX10Q12887 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COX10Q12887 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COX10Q12887 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COX10Q12887 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COX10Q12887 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COX10Q12887 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COX10Q12887 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COX10Q12887 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COX10Q12887 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COX10Q12887 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COX10Q12887 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COX10Q12887 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COX10Q12887 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COX10Q12887 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COX10Q12887 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COX10Q12887 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
COX10Q12887 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COX10Q12887 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COX10Q12887 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COX10Q12887 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COX10Q12887 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COX10Q12887 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COX10Q12887 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COX10Q12887 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COX10Q12887 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
COX10Q12887 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COX10Q12887 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COX10Q12887 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
COX10Q12887 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COX10Q12887 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COX10Q12887 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COX10Q12887 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COX10Q12887 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COX10Q12887 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
COX10Q12887 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COX10Q12887 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COX10Q12887 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COX10Q12887 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COX10Q12887 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COX10Q12887 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COX10Q12887 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COX10Q12887 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
COX10Q12887 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COX10Q12887 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
COX10Q12887 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COX10Q12887 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COX10Q12887 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COX10Q12887 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COX10Q12887 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COX10Q12887 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COX10Q12887 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COX10Q12887 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COX10Q12887 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COX10Q12887 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COX10Q12887 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COX10Q12887 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COX10Q12887 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COX10Q12887 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COX10Q12887 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COX10Q12887 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COX10Q12887 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms