Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KIF5AQ12840 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIF5AQ12840 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms