Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMARCB1Q12824 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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