Protein–RNA interactions for Protein: Q12488

PSF1, DNA replication complex GINS protein PSF1, yeastyeast

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PSF1Q12488 YHR202WYHR202W 1809 nt2.87□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 RPA190YOR341W 4995 nt2.87□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 YDR442WYDR442W 393 nt2.87□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 MMS21YEL019C 804 nt2.87□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt2.87□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 COS8YHL048W 1146 nt2.87□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 PAN5YHR063C 1140 nt2.87□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 RPS21BYJL136C 264 nt2.87□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.87□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.87□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.87□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.87□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 RPL13BYMR142C 600 nt2.87□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 YLR278CYLR278C 4026 nt2.87□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 GAT2YMR136W 1683 nt2.87□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 PGS1YCL004W 1566 nt2.87□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 CDC40YDR364C 1368 nt2.87□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 NTO1YPR031W 2247 nt2.87□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 POL2YNL262W 6669 nt2.86□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 TMA108YIL137C 2841 nt2.86□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 PRS5YOL061W 1491 nt2.86□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 TRM1YDR120C 1713 nt2.86□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 YDR149CYDR149C 708 nt2.86□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 MRPS35YGR165W 1038 nt2.86□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 YJL028WYJL028W 336 nt2.86□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 YJL175WYJL175W 513 nt2.86□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 CDA2YLR308W 939 nt2.86□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 RPN13YLR421C 471 nt2.86□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 AIM39YOL053W 1188 nt2.86□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 TMA16YOR252W 537 nt2.86□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 TAF3YPL011C 1062 nt2.86□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 ARO7YPR060C 771 nt2.86□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 SLM2YNL047C 1971 nt2.86□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 HDA2YDR295C 2025 nt2.86□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 BCS1YDR375C 1371 nt2.86□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 CPA2YJR109C 3357 nt2.86□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 PRP3YDR473C 1410 nt2.85□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 YHL012WYHL012W 1482 nt2.85□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 CAF130YGR134W 3369 nt2.85□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.85□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.85□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 MAK16YAL025C 921 nt2.85□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 ERG2YMR202W 669 nt2.85□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 YBL077WYBL077W 432 nt2.85□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 CPR8YNR028W 927 nt2.85□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 DDP1YOR163W 567 nt2.85□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 YBR238CYBR238C 2196 nt2.85□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 CHO2YGR157W 2610 nt2.85□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 LCB4YOR171C 1875 nt2.84□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 DYN2YDR424C 279 nt2.84□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 ERG26YGL001C 1050 nt2.84□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 AHP1YLR109W 531 nt2.84□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 SEC14YMR079W 915 nt2.84□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 MRPL16YBL038W 699 nt2.84□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 YMR141CYMR141C 309 nt2.84□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 YOR314WYOR314W 330 nt2.84□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 UBP5YER144C 2418 nt2.84□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 YMR1YJR110W 2067 nt2.84□□□□□ -1.95
PSF1Q12488 TEC1YBR083W 1461 nt2.84□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 YPS6YIR039C 1614 nt2.83□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 CDH1YGL003C 1701 nt2.83□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 MRM2YGL136C 963 nt2.83□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 ERV29YGR284C 933 nt2.83□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 ARD1YHR013C 717 nt2.83□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 DOG2YHR043C 741 nt2.83□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 COQ9YLR201C 783 nt2.83□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 MDJ2YNL328C 441 nt2.83□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 TFC1YBR123C 1950 nt2.83□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 EMP70YLR083C 2004 nt2.83□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 MDM1YML104C 3384 nt2.83□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 TIF4631YGR162W 2859 nt2.82□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 TSC11YER093C 4293 nt2.82□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 PCL9YDL179W 915 nt2.82□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 ATP12YJL180C 978 nt2.82□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.82□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 SSO2YMR183C 888 nt2.82□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 TMC1YOR052C 453 nt2.82□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 RPL20BYOR312C 519 nt2.82□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 YBR300CYBR300C 498 nt2.82□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 SER3YER081W 1410 nt2.82□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 POL31YJR006W 1464 nt2.82□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 CCT7YJL111W 1653 nt2.82□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.81□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.81□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.81□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.81□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 ARC15YIL062C 465 nt2.81□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 APC9YLR102C 798 nt2.81□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 MFA2YNL145W 117 nt2.81□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 YOL050CYOL050C 321 nt2.81□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 DSE3YOR264W 1293 nt2.81□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 BMT2YBR141C 1014 nt2.81□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 YGR117CYGR117C 1431 nt2.81□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 RGC1YPR115W 3252 nt2.8□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 EPO1YMR124W 2832 nt2.8□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 LSM6YDR378C 261 nt2.8□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 HAT2YEL056W 1206 nt2.8□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.8□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 SFH5YJL145W 885 nt2.8□□□□□ -1.96
PSF1Q12488 MCM16YPR046W 546 nt2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.7 ms