Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 OAR1YKL055C 837 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 AIM4YBR194W 372 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 HAA1YPR008W 2085 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 SSE2YBR169C 2082 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 ERG1YGR175C 1491 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 SWT1YOR166C 1377 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 NTH1YDR001C 2256 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 PDA1YER178W 1263 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 BUD13YGL174W 801 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 MRPL31YKL138C 396 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 YAR029WYAR029W 225 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 PDP3YLR455W 915 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 SOL1YNR034W 966 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 SUS1YBR111W-A 291 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 FPK1YNR047W 2682 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 GPB2YAL056W 2643 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-DR3Q12441 ASH1YKL185W 1767 nt5.34□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 CDC55YGL190C 1581 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YGR054WYGR054W 1929 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 CAB4YGR277C 918 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 RIO2YNL207W 1278 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 POP3YNL282W 588 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YOR203WYOR203W 354 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 RNR3YIL066C 2610 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 DBP3YGL078C 1572 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 TKL1YPR074C 2043 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 PAL1YDR348C 1500 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YCR007CYCR007C 720 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 FAR7YFR008W 666 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 RPL8AYHL033C 771 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 RPB3YIL021W 957 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YMR320WYMR320W 306 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 TRM112YNR046W 408 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 snR24snR24 89 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 ANR2YKL047W 1551 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 RIM101YHL027W 1878 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 PYC1YGL062W 3537 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 BIO3YNR058W 1443 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 ALG11YNL048W 1647 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 NHP2YDL208W 471 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YDR413CYDR413C 576 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 GRX2YDR513W 432 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YER107W-AYER107W-A 321 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 PHO86YJL117W 936 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 DAD2YKR083C 402 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YML031C-AYML031C-A 336 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 CKA2YOR061W 1020 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 CST6YIL036W 1764 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 CUE3YGL110C 1875 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 EXO5YBR163W 1758 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 UBP6YFR010W 1500 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YPD1YDL235C 504 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YDR476CYDR476C 675 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YGL193CYGL193C 312 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 COX17YLL009C 210 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 RPL18BYNL301C 561 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YOL134CYOL134C 390 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YOR379CYOR379C 339 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 NSL1YPL233W 651 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YPR174CYPR174C 666 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 FLC3YGL139W 2409 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 COX10YPL172C 1389 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 MAL11YGR289C 1851 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 MIH1YMR036C 1665 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 CIA1YDR267C 993 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 TFB3YDR460W 966 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 BNA6YFR047C 888 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YGR035CYGR035C 351 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 OTU2YHL013C 924 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 AFB1YLR040C 675 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 HTZ1YOL012C 405 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 HPA2YPR193C 471 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 AYT1YLL063C 1425 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 PDR18YNR070W 4002 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 FAT3YKL187C 2253 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 FOB1YDR110W 1701 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 VPS33YLR396C 2076 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 TUB1YML085C 1344 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YPT32YGL210W 669 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 RSM25YIL093C 795 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 MAK16YAL025C 921 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 ATP14YLR295C 375 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YNL150WYNL150W 408 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 MDG1YNL173C 1101 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 YOR277CYOR277C 309 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 IMA2YOL157C 1770 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-DR3Q12441 ZPR1YGR211W 1461 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 SRD1YCR018C 666 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YCR090CYCR090C 549 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 ASF2YDL197C 1578 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YDR417CYDR417C 372 nt5.27□□□□□ -1.57
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