Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 HIM1YDR317W 1245 nt3.86□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 ISC10YER180C 804 nt3.86□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 MTC3YGL226W 372 nt3.86□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 Q0144Q0144 330 nt3.86□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt3.86□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YJR096WYJR096W 849 nt3.86□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 RPL22AYLR061W 366 nt3.86□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 PML39YML107C 1005 nt3.86□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 GOT1YMR292W 417 nt3.86□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YGK3YOL128C 1128 nt3.86□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 UAF30YOR295W 687 nt3.86□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 OXR1YPL196W 822 nt3.86□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 RRP7YCL031C 894 nt3.86□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 APA1YCL050C 966 nt3.86□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 DNM1YLL001W 2274 nt3.86□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 GLO3YER122C 1482 nt3.86□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 APN2YBL019W 1563 nt3.85□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 SEA4YBL104C 3117 nt3.85□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 RPS0AYGR214W 759 nt3.85□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 CUP1-1YHR053C 186 nt3.85□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 CUP1-2YHR055C 186 nt3.85□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 TVP18YMR071C 504 nt3.85□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 INN1YNL152W 1230 nt3.85□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 RHO5YNL180C 996 nt3.85□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YOR062CYOR062C 807 nt3.85□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 TAF14YPL129W 735 nt3.85□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 SWP82YFL049W 1872 nt3.85□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 CTK1YKL139W 1587 nt3.85□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 CTR86YCR054C 1692 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 MSN4YKL062W 1893 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YLR177WYLR177W 1887 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YCR100CYCR100C 951 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 ENT5YDR153C 1236 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 STE14YDR410C 720 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 SLX8YER116C 825 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 OTU1YFL044C 906 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 PEX14YGL153W 1026 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 ERG25YGR060W 930 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 PET54YGR222W 882 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YGR283CYGR283C 1026 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 PCL7YIL050W 858 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YKT6YKL196C 603 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 ECM4YKR076W 1113 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 HTA2YBL003C 399 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 REH1YLR387C 1299 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YLR444CYLR444C 303 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YBR013CYBR013C 390 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 THI80YOR143C 960 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 CMD1YBR109C 444 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 ARA1YBR149W 1035 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YBR292CYBR292C 372 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 RPN6YDL097C 1305 nt3.84□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 POL1YNL102W 4407 nt3.84□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 GAT2YMR136W 1683 nt3.84□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 CHS2YBR038W 2892 nt3.83□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 CWC2YDL209C 1020 nt3.83□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 ARC15YIL062C 465 nt3.83□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YKL162CYKL162C 1209 nt3.83□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 RFC3YNL290W 1023 nt3.83□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 PCI8YIL071C 1335 nt3.83□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 SPB4YFL002C 1821 nt3.83□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 REC8YPR007C 2043 nt3.83□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 ZDS2YML109W 2829 nt3.83□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 MDM1YML104C 3384 nt3.82□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 KAP95YLR347C 2586 nt3.82□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 TRE2YOR256C 2430 nt3.82□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 AIM21YIR003W 2040 nt3.82□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 RPN4YDL020C 1596 nt3.82□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 SMP3YOR149C 1551 nt3.82□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.82□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 COS12YGL263W 1143 nt3.82□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 SUI2YJR007W 915 nt3.82□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 CMC1YKL137W 336 nt3.82□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.82□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 RPL18AYOL120C 561 nt3.82□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 RFM1YOR279C 933 nt3.82□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 RPL19AYBR084C-A 570 nt3.82□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 ALO1YML086C 1581 nt3.81□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 SPS2YDR522C 1509 nt3.81□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 MEK1YOR351C 1494 nt3.81□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 KTR6YPL053C 1341 nt3.81□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 CPR1YDR155C 489 nt3.81□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 MPS2YGL075C 1164 nt3.81□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YGL177WYGL177W 348 nt3.81□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YGL218WYGL218W 651 nt3.81□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 SOL3YHR163W 750 nt3.81□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YUH1YJR099W 711 nt3.81□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YAL066WYAL066W 309 nt3.81□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 UFE1YOR075W 1041 nt3.81□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 MAK11YKL021C 1407 nt3.8□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 ALG1YBR110W 1350 nt3.8□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 SIP1YDR422C 2448 nt3.8□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 PST1YDR055W 1335 nt3.8□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 VAC17YCL063W 1272 nt3.8□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YCL075WYCL075W 441 nt3.8□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 AAD3YCR107W 1092 nt3.8□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt3.8□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 MCM1YMR043W 861 nt3.8□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 HAT1YPL001W 1125 nt3.8□□□□□ -1.8
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