Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PUDPQ08623 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms